El Reglamento consta de 16 capítulos y 106 artículos. INDICE: Disposiciones generales (I); Dirección General de Protección y Sanidad Agropecuaria (II); Funciones de la Comisión Nacional de Sanidad Agropecuaria (III); Diagnostico y vigilancia epidemiológica en la salud animal (IV); Diagnostico y vigilancia epidemiológica en sanidad vegetal (V); Dispositivo nacional de emergencia en sanidad agropecuaria (VI); Inspección de animales, productos y subproductos de origen animal (VII); Inspección de los vegetales, productos y subproductos de origen vegetal (VIII); Programas y campañas de prevención, control y erradicación de plagas y enfermedades sanitarias y fitosanitarios (IX); Cuarentena agropecuaria (X); Registro y control de los insumos y productos para uso agropecuario, acuicola, pesquero, forestal y agroforestal (XI); Acreditación de personas naturales y jurídicas para programas sanitarios y fitosanitarios (XII); Coordinación nacional e internacional (XIII); Infracciones y sanciones (XIV); Recursos económicos (XV); Disposiciones transitorias y finales (XVI).; El presente Reglamento tiene por objeto establecer las disposiciones para la correcta aplicación de la Ley Nº 291 de 1998. Se dispone que corresponderá a la Dirección General de Protección y Sanidad Agropecuaria, dependencia del Ministerio Agropecuario y Forestal, normar, regular y facilitar las actividades sanitarias y fitosanitarias en la producción, importación y exportación de animales, plantas, productos y subproductos animales y vegetales, insumos para uso agropecuario, acuicola, pesquero, forestal y agroforestal.
Decreto Nº 2/99 - Reglamento de la Ley Nº 291, Ley básica de salud animal y sanidad vegetal.